在“9·11”事件以后，美國無人機項目一直由中情局掌管。奧巴馬政府正在考慮，讓軍隊負責所有無人機襲擊事務是否會減輕目前由中情局掌管而帶來的法律問題，是否會增加國會與民眾對項目的擔憂。
在國會山，很多議員說他們主要擔心的是，這個已成美國對抗“基地”組織最大秘密工具的項目會落到軍方手中。
他認為，那些擔心中情局在美國本土地美國公民發動無人機襲擊是否會違憲的擔心是不必要的，保持中情局對無人機項目的控制是很明智的。“我不擔心我們放棄自己憲法權利去追剿恐怖分子——我認為我們可以接受目前狀態。”他說。
也有很多議員擔心軍方并不是很精通或不適合執行無人機任務，而中情局在這方面已經做得很完美了。
而支持將軍用無人機項目移交給軍方的人則認為，這能增強對“基地”組織領導與成員使用無人機的合法性。一位前五角大樓的首席律師約翰遜3月18日在紐約的福特漢姆大學法學院的演講中說：“美國軍方的主要任務是抓捕或殺死敵人，作為由國會批準的武裝行動的一部分，無人機項目的基礎會更加牢靠。同時，國會批準武裝行動的標準對公眾是透明的，必須由國會授權，行政部門解釋授權。在國會批準武裝行動標準之外的那些致命武器，在公眾看起來是缺少限制的，也使人懷疑它是否只是代替刑事司法的權宜之計。”
報道稱，可以肯定的是，在反對“基地”組織領導人和成員的任務到底歸軍方還是情報機構的問題上，雙方各執一詞，僵持不下。有的認為“大部分的責任應由軍隊”，而有人認為中情局在實施武裝襲擊前有一個嚴謹的決策過程,但“軍隊的武裝無人機項目卻沒那么講究。”
戰略與國際研究中心分析師，情報顧問安東尼說,軍方和中情局使用無人機襲擊的方法是相當不同的。“跟大多數軍事行動相比，情報機構在不同信息和方法,和不同時間壓力的基礎上進行活動，所以我認為這兩都可能都需要。”
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